opnsense-ports/biology/ncbi-toolkit/files/patch-make-makenet.unx

59 lines
2.5 KiB
Plaintext

--- make/makenet.unx.orig 2008-12-11 00:23:29.000000000 +0300
+++ make/makenet.unx 2011-04-14 00:26:38.440426134 +0400
@@ -67,6 +67,7 @@
VIB =
VIBLIBS= -lXm -lXmu -lXt -lX11
VIBLIBS=
+USERLIBS = -lXft -lpng -ljpeg %%ICONV_LIB%%
SEQUIN_OPTS =
LIBCOPY = cp -p
SRCCOPY = ./ln-if-absent
@@ -934,17 +935,17 @@
$(CC) -o ddv $(LDFLAGS) $(OBJDDV) $(LIB41) $(LIB31) $(LIB20) $(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) $(LIB45) \
$(LIB8) $(LIB7) $(NETCLILIB) $(LIB3) $(LIB4) $(LIB23) \
$(LIBCOMPADJ) $(LIB2) $(LIB1) \
- $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
udv : $(OBJUDV)
$(CC) -o udv $(LDFLAGS) $(OBJUDV) $(LIB41) $(LIB31) $(LIB20) $(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) $(LIB45) \
$(LIB8) $(LIB7) $(NETCLILIB) $(LIB3) $(LIB4) \
$(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB2) \
- $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
Nentrez : entrez.c $(ULIB31)
$(CC) -o Nentrez $(LDFLAGS) entrez.c $(LIB41) $(LIB31) $(LIB30) $(LIB20) $(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) $(LIB45) \
- $(LIB36) $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB8) $(LIB7) $(NETCLILIB) $(LIB5) $(LIB4) $(LIB3) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(LIB36) $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB8) $(LIB7) $(NETCLILIB) $(LIB5) $(LIB4) $(LIB3) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
# left this in (Tentrez) for script backwards compatibility
Tentrez : entrez.c $(ULIB31)
@@ -1140,7 +1141,7 @@
entrez2 : entrez2.c
$(CC) -g -o entrez2 $(LDFLAGS) entrez2.c $(LIB41) $(LIB6) $(LIB20) \
$(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) \
- $(LIB2) $(LIB4) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(LIB2) $(LIB4) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
$(VIB_POST_LINK) entrez2
# demo program (spidey)
@@ -1421,7 +1422,7 @@
$(CC) -o Psequin -I. $(LDFLAGS) -UINTERNAL_NCBI_SEQUIN $(SRCSEQUIN) \
$(LIB30) $(LIB45) $(LIB31) $(LIB20) $(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) \
$(LIB40) $(LIB41) $(LIB36) $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB11) \
- $(ENTREZLIBS) $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(ENTREZLIBS) $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
$(VIB_POST_LINK) Psequin
# 'sbtedit' Submission Template Editor
@@ -1433,7 +1434,7 @@
$(CC) -o sbtedit -I. $(LDFLAGS) -UINTERNAL_NCBI_SEQUIN $(SRCSBTEDIT) \
$(LIB30) $(LIB45) $(LIB31) $(LIB20) $(LIB61) $(LIB60) $(LIB22) \
$(LIB40) $(LIB41) $(LIB36) $(LIB23) $(LIBCOMPADJ) $(LIB11) \
- $(ENTREZLIBS) $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS)
+ $(ENTREZLIBS) $(LIB4) $(LIB2) $(LIB1) $(VIBLIBS) $(OTHERLIBS) $(USERLIBS)
$(VIB_POST_LINK) sbtedit
# 'streamer' Sequinesque Stream Editor